Ein großer Teil des Landes ist gebirgig. Es gibt drei große Gebirgszüge: den mongolischen Altai, Khangai und Khentii.
Die höchste und längste Gebirgskette ist das westlichste, das mongolische Altai-Gebirge, das von der nordwestlichen Spitze des Landes herüberzieht und 600-650 Kilometer in Richtung Südosten vorstößt. Der mongolische Altai besteht hauptsächlich aus den Rocky Mountains und entlang hoher Bergkämme gibt es viele Gletscher.
Es gibt eine Reihe von sauberen Wasserseen entlang der Strecke und Hunderte von Bächen in den Tälern. Einige der größten Flüsse des Landes, einschließlich Khovd, Buyant und Bulgan, bestehen aus Hunderten von kleinen Quellen der Altai Range.
Der mongolische Altai hat viele Gipfel, die 4000 Meter über dem Meeresspiegel liegen. Über 20 Gipfel sind mit ewigem Schnee im Altai-Gebirge bedeckt. Dazu gehört Tavan Bogds Khuiten Peak (4374 Meter), der höchste Punkt der Mongolei. Ein kleinerer Bereich, der nach Südosten abzweigt, ist der Gobi-Altai-Sub-Gebirgszug. Seine südöstlichen Extremitäten teilen sich auch in eine Anzahl kleinerer Hügel, die in den Weiten der Gobi verschwinden.
Die Khangai-Berge bilden eine massive Gebirgsmasse im zentralen Teil der Mongolei. Der höchste Gipfel ist Otgon Tenger (4021 Meter). Charakteristisch für dieses Gebiet sind die sanften Hänge und Hügel, die oft mit schönen Weiden bedeckt sind.
Die Khangai-Berge sind die größten der drei großen Gebirgszüge. Es erstreckt sich 800 Kilometer von Westen nach Osten. Die Landschaft des Khangai-Gebirges unterscheidet sich von den Altai-Bergen. Während im Mongol Altai und im Gobi Altai hohe Felsklippen und tiefe Becken dominieren, zeichnet sich das Khangai Gebirge durch breite, gewölbte, kuppelförmige Berge aus, die mit Gras und Bäumen bedeckt sind. Das Gebiet umfasst mehrere Naturzonen einschließlich Berg- und Bergsteppen, sibirische Taiga und Wald. Fruchtbarer Boden und zahlreiche Flüsse, Bäche und Seen unterstützen eine Vielzahl von Pflanzen und Lebensraum für eine Vielzahl von Tierarten.
Die große Wasserscheide, die das Wasser in die Ozeane und in die Innenbecken ableitet, verläuft entlang des Kamms der Khangai-Berge. Der größte Fluss der Mongolei, die Selenge mit ihrem Hauptfluss, dem Orkhon, mündet nördlich der russischen Grenze in den Baikalsee. Die Flüsse, die entlang des Khangai-Gebirges verlaufen, sind schnell und Stromschnellen in den Flüssen ergeben malerische Wasserfälle wie den Orkhon-Wasserfall mit einer Höhe von 20 Metern, der lokal als Ulaan Tsutgalan bekannt ist.
Der dritte Bergblock ist der Khentii Mountain Range. Er ist kleiner und niedriger als die Altai und Khangai Mountain Ranges. Die Khentii-Gebirgskette beginnt östlich von Ulaanbaatar und erstreckt sich bis zu den großen östlichen Ebenen. Es gibt mehrere Gipfel, die sich über 2500 Meter über dem Meeresspiegel erheben, wobei der höchste Gipfel Asralt Khairkhan ist, der uralte glaziale Spuren aufweist. Die Khentii-Berge sind von Wäldern, Feuchtgebieten, alpiner Tundra und permanenten Schnee- und Eisfeldern bedeckt; Der Kern dieses abgelegenen Wildnisgebiets ist völlig unbewohnt.